1. Необходимо запустить Powershell от имени администратора и выполнить данную команду:
[System.Environment]::SetEnvironmentVariable('ASPNETCORE_ENVIRONMENT', 'ProdWin', [System.EnvironmentVariableTarget]::Machine)
2. Заново скопировать appSettings.ProdWin.json (appSettings.ProdLin.json) из архива WebApi.zip в папку WebApi на сервере и внести в этот файл необходимые настройки.